约定没付清款协议无效的股权转让协议是无效的。有限责任公司设立登记后，股东可以相互转让股权；股东大会通过后，股东可以将股权转让给股东以外的人。股东转让股权，转让人与受让人签订转让协议后，受让人直接支付转让人支付的公司出资额，无需再次向公司投资。经公司登记机关批准变更登记后，成为公司股东。公司股东之间签订股权转让协议，由转让人向受让人转让其所持有的公司股权。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国公司法》
第七十一条 有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。
股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。
经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。
公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。
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