楔子
清晨的风吹进了奇兽居，一觉醒来，水灵儿才听楚女说主人嫦娥奔月去了，后羿为此大发雷霆,情绪也变得时好时坏。听完楚女的叙述，水灵儿决定出宫去找主人。
来到人王殿，后羿恨嫦娥偷吃仙丹，痛斥她无情。忆起水灵儿是嫦娥所养，迁怒于水灵儿,将他赶了出来。出来后，在后花园找到赵女，在前花园找到湘女，得知两颗不死仙丹一起吃，会有三百天的蟾蜍期，而后羿也为此愈加暴躁。回到奇兽居,遇到湘女,原来湘女是来通风报信的，后羿要把水灵儿抓起来关到北海去。此时, 赵女打开了秘道,于是, 水灵儿出逃，踏上了冒险旅程。
秘道里有些丹药,走到尽头时魔兽水玄武出现。将其打败后,就可以走出秘道，见识一下外面的世界了。最后一个宝箱可别忘了开哦，可学到“水疗咒”。
第一章天地变动
来到临王市集,进入民宅一,可以得到“冰虺曲剑”。进入民宅三，老者会谈论一些有关命缘之域的故事，不妨一听。听市集上的人说，女丑庙里的女丑娘娘是有求必应的！女丑是著名的女巫，当初十个太阳出现时，人们请她出来解决旱灾。因为知道太阳是天帝之子，女丑便用传心术与他们对话，太阳不但不买账，还将女丑烤死。人们为了纪念她，便建了女丑庙。来到女丑庙，守护在门口的鲮鱼却不让进！哼，打！（其实他很友善）进去后，女丑讲了事情的来龙去脉，告知幻兽转邪之事，还教了水灵儿传心术及一招“千层浪”。并得到配合藤环使用的“意幻木文片”。
穿过春晨之野，到达畴华大街，在知兽之屋与主人锦言交谈，得知要上昆仑山，得先取得四大属性的元化之物。之后会遇见第二个奇兽-温焰！（选择“不同意”，看看会怎样？哈哈……）在民宅一可以获得火涎丸，在民宅三遇到锦言的妹妹，交谈后获得米砖，在民宅四，与主人交谈两次，温焰会练成“烈火杀”，在民宅六可以获得兽文片，水灵儿从中学会“冰水刺”！
穿过秋岚之野，打开一个宝箱，水灵又练成“冰泉玉治”，走右侧，来到忘魂之崖，打开宝箱，水灵儿可练会“天幕浪”！向左走到达荆路之径，在入口处的宝箱里，水灵儿学会新武学“覆江浪”。从中间走到达火焰之村，等温焰收拾完，左侧的宝箱一定要开呀！会增添很多乐趣哦！到达赤火墩，然后来到朱火洞，在玄火山得到配合竹蜻蜓使用的“契阴角文刺”。
进入成叹之谷后，火系最强的幻兽火恨出现。实力是硬道理！打败他后，得到“火之珠”。火恨一副诚心相让的样子，还教育水灵儿要好好对待温焰，他居然说温焰就像他的妹妹一样！搜索一番，得到飞絮刀和六翼弓之后，就该向悔恨之壁进发了。 来到悔恨之壁，按照惯例，要打败曾是水神共工军师的相柳，才能看兜率图。那就打吧，谁让这是上昆仑山的条件呢！打败后发现兜率图上有一片模糊，原来是烛龙峰魔气外泄所致，这股魔气对幻兽影响较大，有很多幻兽都转邪了。水灵儿等也或多或少受了影响，变得暴躁。相柳还告诉水灵儿，要见嫦娥，可以去找少司命试试。
第二章雒嫔之恋
来到雒林之野，女丑娘娘出现，为水灵儿和温焰解开第一重封印。宝箱里有云烟刀。
进入临河部落，听说这里住这一位医术高明的河素之婆，最近不见了。来到河素之婆的住所，发现屋子不像长久没人住的样子，显然有人常来打扫。在民宅四，又听到一些关于河素之婆和杨水居士的事。在民宅二，和一位老婆婆谈及后羿,嫦娥和河妃三人之间的感情。在民宅三，得到拟马似翼甲，民宅六得到食物。晚上去知兽之屋，找镇藏谈话会得到抉火音铃，并得知雷,水系的元化之物都在附近。来到杨水居士的住处会知道关于祭祀的事情。
出临河部落，在雒林之野的右上角使用抉火音铃，来到凶林山麓。在入口的宝箱里得到配合陀螺使用的“深竹奔流片”。在出口掉入陷阱。此时，第三只奇兽，“宇宙第一大帅哥”胜奇出场了。温焰展现女子细心本色，再加上刁蛮手段，把本想捉弄别人的胜奇耍了一通，最后胜奇加入队伍。
在凶林山道的宝箱里温焰学会“焰火尽”，穿过凶林之村，来到凶林山崖，遇见雷系最强的幻兽雷音，击败他得到“雷之锤”，紧接着胜奇学会新招式“闷雷盖顶”，宝箱中可得到盔甲“翼铜会灵”。
再次回到临河部落，白天去民宅五，与老者交谈，得知多年前有一双水灵儿和温焰曾经寻找封印的方法，想要封印邪神“恨海”和“情丝”。老者将前水灵儿留下的“碧愁剑”（剑名也有一段凄惨的故事哦）送给水灵儿。给晚上到杨水居士那里谈话，会得到“河神祭通”，在知兽之屋休息，早上来到幻神之海，打败水鲲并把他囚禁起来。打开宝箱，学会招式“水漫如沐”！
来到泳思之地，在宝箱里可以拿到“鹦螺贝珠甲”，打开宝箱水灵学会“冰山震”，穿过泊舟之矾，在宝箱里胜奇练成新招式--雷疗咒，水灵练成“冰雪崩”。
到达雒嫔之河，在这里遇见水幻神，击败她后，得到元化之物“水之瓶”，水灵又练成一式“冰风暴”。打开旁边的宝箱，可以得到配合铃鼓使用的“勾阳绣阴布”。来到河妃神宫，雒嫔出现（一段漂亮的动画），依照剧情来到神宫内部。雒嫔问起后羿的近况，并得知原来胜奇是河素之婆所养。此时，后羿难忍相思之苦，来看雒嫔。未免越理越乱，雒嫔挥剑斩情丝，以言词激走后羿。经过谈话，众人得知嫦娥奔月的缘由。最后，河妃用“落花飘灵”送诸人来到窈窕之滩。在这里遇见女丑娘娘，再次为水灵儿等解开封印。水灵儿等人又饮用窈窕之滩的水以暂时镇压魔性，减轻魔气的影响。宝箱里可以获得“紫金冰甲”，同时水灵学会新武学“冰无涯”。
来到了奚禄之村，在知兽之屋与主人风骨谈话，来到极古老人的住处，得到“天虹之彩”。在民宅一，遇到极古老人的妹妹，得知一段有关极古老人的故事。民宅五遇到异经门门徒，得知一些关于少司命和求真的事。
走进少司之林在宝箱里可以获得配合灯笼使用的“炎火骨文片”，走过奚禄之洞，妙灵之洞，遇见爱睡觉的妙思。在宝箱里得到“衔鬼符弓”（这一路上宝箱好多，慢慢拿吧）。来到妙影之地，
在宝箱里温焰学会新武学“风火绝”。在宝箱里可以得到“澄火剑”，来到妙法之池，遇见金揩霞，将其打败，会得到“金之钥”，在宝箱里可得到“暮雪剑”。回到少司之林，来到天文奇岩，在天金洞的宝箱里可得到“狂饮刀”和“之初骨文片”，来到采花之林，在宝箱里可得到“叶缀银苏甲”。在出口遇见金迷，打败他，胜奇学会新武学“狂雷啸天”。
第三章少司命之言
走到了命缘之域，水灵在宝箱里学会“水色漫天”，妙思也学会“元金法”。但无法过去，回奚禄之村，在民宅四会遇到女丑的妹妹女伶，和她说话，她会告知：女丑托她教给他们几样功夫（水灵儿:雷雨无边；温焰:掣火钉；胜奇:追雷急电；妙思:亢金法）。在民宅六见到一书生，与之对话水灵会得到“泷水元疗”。在知兽之屋休息，晚上回到天文奇岩见到极古老人，经过谈话后回到命缘之域，念起咒语得到“如意咫尺手”。来到少司命宫，遇见天涯海角，将其打败后进入少司主殿。与四个少司命对话，得知后羿与雒嫔恋情始末以及关于盘古，黄帝，嫘祖的传说。之后，少司令天涯海角送他们到风丘之桥。
在风丘之桥一箱中可获得配合竹球使用的“天枢骨文片”。来到青沼大街，女丑再次出现，为其解除封印（在这里可选择进化一形或二形）。在民宅一，遇到柳作眉,水灵可以学到“彩迷光”，在民宅二，可以得到盔甲“邪骨兽甲”，在民宅四遇到百难之父，可学到“横雷如雨”。来到这里的知兽之屋，交谈后，到异牙之阵，在一个宝箱里，妙思可以学到“引金护体”。 出阵后，在宝箱里得到“异古三轩琴”。
再次来到风丘之桥（使用异古三轩琴），打开通往异化之谷的通道，遇见求真，与其交谈，方知河素之婆就是月净，当初与求真之兄相恋而被贬下凡间,她的姐妹也被封印神力,化为九尾狐狸,每五百日遭受一劫。而后羿正是这段不完美爱情的产物……听到这里，胜奇再也忍不住，一个人跑了出去。妙思见状，连忙跟了过去。也许，胜奇早已从月净那里学会将笑容展现给别人，而将悲伤藏在心底。求真也因为哥哥的死而一直在寻求推翻天庭的方法。（宝箱里找到“卷麟青甲”和“气焰
刀”。）
走到异希之门，胜奇正唱着那首“落花梦”：花落已成诗，短聚难分时，恨字融泪散，哽咽难成词……妙思则静静的陪他站在一旁。那首歌是为月净而作，祭日那天所有的九尾狐狸都会唱这首歌以纪念月净。良久，水灵儿才走上前……
之后在宝箱里可以得到“极目玄弓”，水灵又学会新武学“天冰柱击”，来到了异经之台，妙思在宝箱里可以学会“捋金锋击”，继续往前走，来到异言圣地，再通过异奇密道，在这里水灵又学会一项新武学“玄冰万劫”于是到达幻兽之屋。
宝箱里有“乌纹革金甲”，这里可以学会“疗雷交加”。与求真谈话再次来到烛龙奇峰调查魔气的问题，遇见雷猿，将其打败到达奇峰秘境，见到知兽老人。交谈后，会得到“天历刀”。之后来到华胥之泽，在宝箱里可以得到“古瀚云甲”和配合木马使用的“七缺骨文片”。
在雷泽，温焰可以练成“雷火碧”，在风泽，胜奇可以练成“纵雷卷风”，在宝箱里可以获得“峦雷刀”。之后来到句芒之规，宝箱里可以得到“红蓄澄思甲”，在出口处温焰可学得“云火疾”，遇见雷刺狼，将其打败，进入天梯遗迹。
此时，后羿与河伯为河妃而战！后羿开弓搭箭，射向河伯。关键时刻，河妃出现，挡在河伯之前。箭，穿胸而过……后羿大惊失色，将垂死的河妃紧紧抱住，泪水盈眶。河妃看着后羿，情深款款：“能死在你怀里，我心满意足。你是我心中的英雄，英雄，不可以流泪……”后羿的泪奔涌而出……与此同时，重伤的河伯一剑刺向后羿，一切归于平静……
得到后羿的“射日神弓”（如果以前选择进化一形）和河伯的“遗恨剑”后进入仙狐之村，在村口遇见风菁华，与其对话，在宝箱里温焰可以学会“天火奔”，宝箱里还有“一恸剑”。
第四章天地之始
到达素女瑟弦，风菁华等人正在祭奠月净，众人散去后，她会拿出“九尾邪刀”（同样要选择进化一形）。风菁华走后，女丑告诉他们离开这里，打开刚才的“天历刀”，来到玄牝极地。遇见看守玄烛兽，将其打败，可见到开天初始图，从而见到伏羲和女娲灵魂，得知世界的来源以及邪神与天界的恩怨。在宝箱里可得到“淑水剑”两把。到达天河云道。在天河云道的宝箱里可以得到配合封肆弹弓使用的“十三玄兽纹”，温焰也可学到“圣火弛”。
来到毋逢大街，在民宅三，遇到楚女得知逢蒙要暗杀大王，大家逃出，找大王报警。在民宅二，遇到颜似葵，得知她在躲五百天劫，给她“天虹之彩”，让她去妙灵之洞避难，可得到“棘麟镶虹甲”。在民宅五，遇到极古老人之妻，可得知一段小故事。与知兽之屋的灵光交谈后，出毋逢大街，来到映月之境，水灵可学会“滔天巨浪”。回到大街在再见楚女可得到一些食物。在民宅一，见到锦言和慎藏，水灵可学得其终极武功“兽圣华光”。来到知不言屋，得知妙思原是知不言所养，而邪神解封之事已无法挽回，只得继续前进。
来到青芜之园，在入口处，水灵又学会了“翻江倒海”。在溺水之洞，宝箱里可得到盔甲“天圣如罡甲”和配合玉宝丝羽扇使用的“玉牙梵泽骨”。在出口处拿出“水之瓶”念动咒语可来到会雷之麓，用传心术问询女丑，得知使用“雷之锤”便可通过，在这里胜奇学会“怒雷肃杀”。
来到巨炎山道，打败火麟，温焰可学会“绝火寰尽”。接着到了洪荒山道，宝箱里可得到“风动披云甲”与“神弛刀”，在出口处使用“金之钥”，终于踏上了昆仑山。在昆仑山顶，青鸟出现，打败他后得知温焰的身世以及与少黎和大黎的恩怨。来到三危怪峰，在宝箱里，胜奇学会“愁雷盈恨”。打败少黎，终于可进王母神殿了！
来到王母神殿，在宝箱里可拿到“天水流波剑”，打败大黎。进入西王母殿，与王母对话，却被其骂出。来到不死之树，打败金法龙，得知不死之树的渊源。西王母出现，这次却很温和，被其带回王母神殿，在西王母的帮助之下，终于见到了主人—嫦娥！身下的事就是封印邪神，防止天下大乱了。
来到古皇遗冢，在天机之轮前，使用“如意咫尺手”，黄帝与嫘祖会现身（他们说的话要认真记住），在宝箱里得到“白餐玄兽甲”与“仲文千叠”。来到生无灭顶，终于见到邪神玲珑了！最后一战来临了，这可是最艰苦的一战，大家要做好准备。
结局一：如果在与玲珑的战斗中失败，玲珑解开邪神无赦的封印，天庭崩裂！
结局二：在与玲珑的战斗前,温焰装备“火之珠”，水灵儿装备“射日神弓”，胜奇装备“九尾邪刀”。先按F8,用“火之珠”破隐身，玲珑变身时，用“九尾邪刀”攻黄帝，用“射日神弓”攻嫘祖。胜出后，自然是皆大欢喜，水灵儿 Vs 温焰,胜奇Vs 妙思,这两对可有得看了！水灵儿和温焰去青芜之园隐居，他们还有了一个小宝宝，不知道会不会是大耳朵，红皮肤呢？胜奇和妙思则去了凶林之村。直到有一天，他们又卷入了另一个故事……
结局三：如果当初选择进化二形，在与黄帝和嫘祖交谈后，出来念咒语可得到“初始剑”和“开天刀”，功用同“射日神弓”和“九尾邪刀”。打胜后大家一起去仙狐之村隐居。也会看到动画，不一样的哦。
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