为什么要将多重序列比对引入蛋白质二级结构预测?如何进一步提高蛋白质二级结构预测的准确性?

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热心网友

首先你要知道Protein二级结构预测是有根据的预测
现在的二级结构预测都是建立在蛋白质序列比对的基础上进行的,在已有的数据库基础上,将你的目标序列筛选数据库,比如目标序列中的某一段序列与其他很多蛋白质中跨膜结构域的一级序列相似度极高,那么就可以推测你的目标序列中的这一段序列可能为跨膜结构域。
一般预测结构域的方法是利用2个以上的预测软件进行分析。我原来也回答过一个关于结构预测的问题,软件多为在线的,提交后网站会返回一个文件,要用特殊的软件来打开。
当然既然是预测就有可能出现错误,更精确地方法就是用实验去验证,比如晶体衍射等方法。

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